% ابتدا دستور زیر را جایگزین تعریف فرمان Quick Build کنید:
% xelatex --shell-escape -interaction=nonstopmode -synctex=-1 %.tex
% در اینصورت، می‌توانید دستورات
%\usepackage[extrafootnotefeatures,quickindex]{xepersian}
%\twocolumnfootnotes
% را در فایل preamble فعال کنید و دستور
%\usepackage{xepersian}
% را غیر فعال کنید.
%============================================
% برای تولید واژه‌نامه بوسیلۀ نرم افزار Xindy، دستور زیر را فعال کنید:
%\immediate\write18{xindy -L persian -C utf8 -I xindy -M \jobname.xdy  -t \jobname.glg -o \jobname.gls \jobname.glo}
% همچنین، بعد از فعال کردن دستور بالا، دستورات
%\usepackage[xindy]{glossaries}
%\makeglossaries
% را در فایل preamble فعال کنید.
% برای تولید نمایه به کمک نمایه ساز Xindy، باید فرمان
% xindy -L persian -C utf8 -M texindy -M page-ranges %.idx
% را روی فایل خود اجرا کنید (%=نام فایل).
%============================================
\documentclass[12pt]{report}
\input{preamble}

%============================================ Begin Document
\begin{document}
\setlength{\baselineskip}{1.5\baselineskip}
% بسم الله اار حمن الر حیم
\thispagestyle{empty}
\begin{center}
\vspace*{\fill}
\centerline{{\includegraphics[width=12cm]{besmel}}}
\vfill
\end{center}
% صفحۀ نام و عنوان پایان نامه
\newpage
\thispagestyle{empty}
\input{Title_fa}
% صفحه صورت جلسه دفاع
\newpage
\thispagestyle{empty}
\input{defa}
% صفحه تقدیر و تشکر
\newpage
\thispagestyle{empty}
\input{Taqdir}

% صفحۀ چکیده
\newpage
\setcounter{page}{0}
\pagenumbering{alph}
\pagestyle{plain}
\input{Abstract_fa}


\tableofcontents
% صفحۀ پیشگفتار
%\newpage
%\setcounter{page}{0}
%\pagenumbering{alph}
\input{Preface}
% فصل ها
\newpage
\setcounter{page}{1}
\pagenumbering{arabic}
\pagestyle{plain}
\input{Chapter1}
\input{Chapter2}
\input{Chapter3}
\input{Chapter4}
\input{Chapter5}
%\input{Chapter6}
%\input{Chapter7}
%\input{Chapter8}
%\input{Chapter9}
%\input{Chapter10}
%\input{Chapter11}

\newpage
\pagestyle{plain}
\input{reference}

\clearpage
%\printbibliography

%\def\glossaryname{واژه‌نامه}
%\printglossaries
\printindex
\input{Chapter12}
\newpage
\pagestyle{empty}
\input{Abstract_en}
\newpage
\input{Title_en}

\end{document}
%============================================ End Document