\documentclass[12pt,a4paper]{report}
\usepackage[pagebackref=false,colorlinks,linkcolor=red,citecolor=magenta]{hyperref}
\usepackage[top=20mm, bottom=20mm, left=20mm, right=20mm]{geometry}
\usepackage{xepersian}
\usepackage{bidiftnxtra}
\title{تشخیص سلول های طبیعی از سلول های تومور با استفاده از شبکه های تعامل پروتئین}

\author{حسینعلی رحمانی دشتی}
\date{بهمن ۹۳}

\begin{document}
\maketitle
\begin{abstract}
این یک مقدمه است.
\end{abstract}
\renewcommand{\baselinestretch}{1.5}\normalsize
\def\contentsname{فهرست}
\tableofcontents
\renewcommand{\baselinestretch}{0.2}\normalsize
\chapter{معیارهای ارزیابی}
\newpage
\section{مرکزیت نزدیکی\LTRfootnote{Closeness Centrality}}
ش
\section{مرکزیت بینابینی\LTRfootnote{Betweenness Centrality}}
ش

\section{قطر گراف\LTRfootnote{Graph Diameter}}
برای محاسبه قطر در گراف از بسته \lr{iGraph} و تابع \lr{diameter} موجود در آن استفاده می نماییم.
\\
به عنوان مثال فرض می کنیم گراف تصویر زیر را داریم:
\\
\begin{figure}[h]
\centering 
\includegraphics[width=180mm]{imgs/Diameter.png}
\caption{گراف نمونه برای محاسبه قطر}\label{fig:threaded_processes}
\end{figure}
\\
شکل کلی تابع \lr{Diameter} به صورت زیر است:
\\
\\
\lr{diameter(graph, directed = TRUE, unconnected = TRUE, weights = NULL)}
\end{document}